目前對咳嗽變異性哮喘的發病機理，大多數學者認為與典型的哮喘病的機制是一致的，是一種氣道變應性炎症。僅僅是病程進展程度不同或氣道炎症的嚴重程度不一而已。 一般對於小兒變異性咳嗽，我們可以採取以下的機制予以治療和預防。
積極查找致敏原常見為吸入某些植物花粉屋塵螨真菌孢子動物皮屑食物中的魚蝦或接觸油漆染料等。要仔細觀察每次咳嗽發作前有什麼因素存在，找出致敏因素，加以避免，防止再次接觸。
避免誘因咳嗽變異性哮喘發作的誘因可有三種可能一是氣候改變，冬春季為高發期，冷空氣刺激為主要誘因，因而要作好保暖防護，特別是冬季清晨出門要穿暖和並戴上口罩;二是運動後咳嗽加重，因而有此類哮喘患兒要避免劇烈運動;三是情緒激動大哭大鬧亦可誘發咳嗽發作，因而要盡量使患兒保持情緒穩定。
增強機體免疫功能咳嗽變異性哮喘實質是哮喘，而哮喘是變態反應性疾病，即因免疫功能異常而引起變態反應因此要注意改善和增強機體免疫功能。
治療咳嗽變異性哮喘的原則與哮喘相同，因發病機制與哮喘病相同，都是存在氣道慢性變態反應性炎症及氣道高反應性的病理改變，所以，較長期地應用控制藥物--吸入激素或白三烯受體拮抗劑，能取得較好療效，療程可較治療哮喘時間短。雖然，白三烯受體拮抗劑的抗炎作用沒有激素強，但對於不願意應用吸入激素治療或病情輕的患兒可推薦使用，現在白三烯受體拮抗劑已被用於2歲以上患兒。
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