關於胡桃的藥用價值，古代已有明確記載，如《開寶本草》謂胡桃仁“食之令人肥健潤肌黑髮”；《本草綱目》認為胡桃仁“補氣養血，潤燥化痰，益命門，利三焦，溫肺潤腸。治虛寒喘嗽腰腳重痛心腹疝痛血痢腸風，散腫毒，發痘瘡，制銅毒。”中醫學認為，胡桃仁味甘性溫，入肺腎大腸經，有補腎助陽補肺斂肺化痰定喘潤腸通便澀精止遺等多種功能。
臨床常用胡桃仁配生薑細辛五味子治虛寒咳喘；配杜仲川斷補骨脂治腎虛腰酸足軟遺精陽痿；配當歸肉蓯蓉枳殼治腸燥便秘；配石葦瞿麥萹蓄治石淋腹痛尿血；配土茯苓苦參蛇床子，炒焦研成糊狀外敷，可治濕疹皮炎。
除胡桃仁可入藥外，青龍衣味苦澀性平，可治白癜風病毒性肝炎；核桃殼可治疥癬；分心木味苦澀性平，配芡實補骨脂枸杞子可治腎虛遺精；胡桃枝可治腫瘤；胡桃葉有抗炎降血壓的作用。
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